MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	TCGTC	2	10	24	33	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NT_187135	AGTG	2	8	34	41	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187135	TGGC	2	8	72	79	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NT_187135	GGT	2	6	90	95	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187135	TGA	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187135	TCT	2	6	154	159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187135	CCA	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187135	CCA	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187135	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187135	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187135	TAAA	2	8	1500	1507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187135	TCA	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187135	CGC	2	6	1898	1903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NT_187135	CAG	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187135	ATCC	2	8	1970	1977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187135	AGC	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187135	A	6	6	2047	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187135	T	6	6	2150	2155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187135	ATA	2	6	2158	2163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187135	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187135	ATG	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187135	TAT	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187135	TAAA	2	8	3131	3138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187135	TAA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187135	TCTT	2	8	3196	3203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NT_187135	ATC	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187135	A	6	6	3974	3979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187135	TAT	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187135	TTTA	2	8	4018	4025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187135	TAA	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187135	TTC	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187135	TCA	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187135	GAA	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187135	CTT	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187135	TCAT	2	8	4966	4973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187135	ATT	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187135	CAGG	2	8	5052	5059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NT_187135	AAC	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187135	ACGGA	2	10	5126	5135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NT_187135	GCA	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187135	TCT	2	6	5154	5159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187135	TGAA	2	8	5170	5177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187135	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187135	ACA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187135	A	6	6	5267	5272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187135	AATC	2	8	5283	5290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187135	GAAA	2	8	5306	5313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187135	CGGAAA	2	12	5371	5382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NT_187135	ATTA	2	8	5409	5416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187135	GTTT	2	8	5417	5424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187135	TTTGT	2	10	5426	5435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187135	TGA	3	9	6436	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187135	GCG	2	6	6464	6469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187135	AAG	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187135	TGA	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187135	GGCA	2	8	7550	7557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NT_187135	GAT	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187135	T	7	7	7619	7625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187135	ACG	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187135	A	7	7	7716	7722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187135	AAT	2	6	7731	7736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187135	TAA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187135	CAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187135	TA	3	6	7769	7774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187135	TAT	2	6	7795	7800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187135	ATA	2	6	7826	7831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187135	TTAC	2	8	7886	7893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187135	ATT	2	6	7921	7926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187135	GAA	2	6	7944	7949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187135	ATC	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187135	T	7	7	8021	8027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187135	A	7	7	8056	8062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187135	TCA	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187135	TGG	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187135	TTTA	2	8	10171	10178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187135	ATT	2	6	10185	10190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187135	T	6	6	10192	10197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187135	AAT	2	6	11279	11284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187135	TTA	2	6	11301	11306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187135	GTT	2	6	11374	11379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187135	TGT	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187135	CCA	2	6	11909	11914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187135	A	7	7	11941	11947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187135	TTAAAT	2	12	11952	11963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187135	TA	4	8	11968	11975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187135	TA	3	6	11987	11992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187135	AAC	2	6	12145	12150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187135	GTGAA	2	10	13702	13711	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187135	ACG	2	6	13880	13885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187135	T	6	6	13913	13918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187135	GGA	2	6	13977	13982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187135	ATG	2	6	14790	14795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187135	ATG	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187135	ACA	2	6	14845	14850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187135	CAT	2	6	14871	14876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187135	AAG	2	6	14892	14897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187135	T	6	6	14993	14998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187135	AAT	2	6	15019	15024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187135	ATTT	2	8	15029	15036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187135	AAT	2	6	15067	15072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187135	ATAA	2	8	15096	15103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187135	TCA	2	6	16456	16461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187135	CTC	2	6	16789	16794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NT_187135	GGGGT	2	10	16828	16837	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187135	CTT	2	6	16911	16916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187135	TTG	2	6	18836	18841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187135	GATT	2	8	18845	18852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187135	GGA	2	6	18858	18863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187135	AGGT	2	8	19020	19027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187135	AAT	2	6	19187	19192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187135	TG	3	6	20505	20510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187135	CCA	2	6	20537	20542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NT_187135	CA	3	6	20571	20576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NT_187135	GA	3	6	20613	20618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187135	GCCA	2	8	20624	20631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NT_187135	ACT	2	6	20651	20656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187135	ATC	2	6	20692	20697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187135	GGC	2	6	42725	42730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187135	TCT	2	6	42740	42745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187135	GTG	2	6	42762	42767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187135	ATA	2	6	42779	42784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187135	AGG	2	6	43000	43005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187135	GCC	2	6	43013	43018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NT_187135	CTG	2	6	43022	43027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187135	GTA	2	6	43031	43036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187135	TATC	2	8	43059	43066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NT_187135	T	6	6	43622	43627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187135	GTA	2	6	43643	43648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187135	CAA	2	6	43672	43677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187135	GAAA	2	8	43697	43704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187135	TATG	2	8	43716	43723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187135	GTTT	2	8	43759	43766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187135	CAAA	2	8	43769	43776	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NT_187135	GAA	2	6	43788	43793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187135	CT	3	6	43868	43873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NT_187135	AT	3	6	45149	45154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187135	A	6	6	45292	45297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187135	GC	3	6	45328	45333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NT_187135	TCA	2	6	45361	45366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187135	CGCTT	2	10	45439	45448	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NT_187135	GTA	2	6	45460	45465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187135	TAA	2	6	45483	45488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187135	GT	3	6	45680	45685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187135	GCAG	2	8	45694	45701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NT_187135	CAG	2	6	45762	45767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187135	TGC	2	6	46362	46367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NT_187135	GGA	2	6	46557	46562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187135	ATG	2	6	46613	46618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187135	CGT	2	6	47475	47480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NT_187135	GAC	2	6	47505	47510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NT_187135	CTTT	2	8	48635	48642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NT_187135	T	6	6	48640	48645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NT_187135	ATC	2	6	48647	48652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NT_187135	GCTT	2	8	48654	48661	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NT_187135	CTG	2	6	48697	48702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NT_187135	CAA	2	6	48806	48811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NT_187135	CCT	2	6	48857	48862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NT_187135	CAAAAT	2	12	48870	48881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
159	NT_187135	ATTT	2	8	48888	48895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NT_187135	A	6	6	48928	48933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NT_187135	CAT	2	6	48934	48939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NT_187135	GAA	2	6	52745	52750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NT_187135	TA	3	6	52933	52938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NT_187135	GCG	2	6	53168	53173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NT_187135	TTCAG	2	10	53803	53812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NT_187135	GCC	2	6	53849	53854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NT_187135	A	6	6	54303	54308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NT_187135	CGC	2	6	55455	55460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
169	NT_187135	GCG	2	6	55465	55470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NT_187135	GCG	2	6	56294	56299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NT_187135	AAGGAT	2	12	56319	56330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187135	TCC	2	6	56356	56361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NT_187135	GTT	2	6	56364	56369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NT_187135	TTTA	2	8	56488	56495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NT_187135	CCG	2	6	56507	56512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
176	NT_187135	CGT	2	6	56519	56524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NT_187135	GAC	2	6	56659	56664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NT_187135	T	6	6	56680	56685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NT_187135	CGG	2	6	57201	57206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NT_187135	CCG	2	6	57213	57218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NT_187135	CG	3	6	57468	57473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NT_187135	GA	4	8	57500	57507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NT_187135	CGC	2	6	57511	57516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NT_187135	GCG	2	6	57521	57526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NT_187135	CTCTC	2	10	57534	57543	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
186	NT_187135	GGCA	2	8	58232	58239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
187	NT_187135	AAAC	2	8	58894	58901	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NT_187135	ATG	2	6	59477	59482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NT_187135	GA	4	8	59515	59522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NT_187135	ATC	2	6	59808	59813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NT_187135	GCC	2	6	61878	61883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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193	NT_187135	T	6	6	65189	65194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NT_187135	A	6	6	65225	65230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NT_187135	GGCCGT	2	12	65260	65271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
196	NT_187135	GCG	2	6	65282	65287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
197	NT_187135	AAC	2	6	65311	65316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NT_187135	A	7	7	65389	65395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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207	NT_187135	CTG	2	6	67413	67418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NT_187135	GAG	2	6	81701	81706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.